Pago en Linea con Saldo a favor.

Hola buenas tardes.
Realice mi pago de colegiatura en linea pero utilice el "saldo a favor" y pague una cantidad menor. Cuando volví a entrar al menú seguía la colegiatura "POR VENCER" completa, ¿no realice el pago correctamente? ¿es como si no hubiera pagado nada de la colegiatura?